6号展厅-深蓝宝藏——南海西北陆坡一二号沉船考古成果特展

7号展厅-做海——南海渔家文化展（海南）

1、2号展厅-南海人文历史陈列

3号展厅-八百年守候——西沙华光礁Ⅰ号沉船特展

5号展厅-探海寻踪——中国水下考古与南海水下文化遗产保护

10号展厅-南海自然生态陈列